Rで作成した図表を「パワポでくれ」と言われた時の対処法
2020年9月7日現在、GitHub版ではofficer関連の対応がされたようだ。
niszetさん（id:niszet）から、コメントで教えていただいた。
GitHub上のexportパッケージをインストールしてコードを一式流してみたのですが、現時点(2020/Sep/06）では一通りコードが動くことを確認しました。 table2*** 関数の内部で使用している、
flextableパッケージ起因の警告が出ていますが、それ以外は期待した動作をしていると思います。また、
broom::tidy(iris3)も警告は出ますが値が表示されるようです。
セットアップ
CRANは相変わらず凍結中なので、GitHubから最新のバージョンをインストールする。
install.packages("officer") install.packages("rvg") install.packages("openxlsx") install.packages("ggplot2") install.packages("flextable") install.packages("xtable") install.packages("rgl") install.packages("stargazer") install.packages("tikzDevice") install.packages("xml2") install.packages("broom") install.packages("devtools") library(devtools) devtools::install_github("tomwenseleers/export")
パワポにする
基本的には、exportパッケージが提供する関数に、何も考えずにオブジェクトを放り込むだけ。
描画オブジェクトを Microsoft PowerPointにエクスポート
直前にプロットした描画オブジェクトをPowerPointに埋め込むことができる。ファイル名を指定しないとRplot.pptxという名前で出力される。
ggp <- iris %>% ggplot(aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, colour = Species)) + geom_point() ggp
graph2ppt() > Exported graph as Rplot.pptx
ベクター形式で出力されるため、PowerPointで開いて［グループ化］から解除⇔再グループ化が可能。
ggplotでなくてもOK。
plot(Sepal.Length ~ Sepal.Width, data = iris)
graph2ppt() > Exported graph as Rplot.pptx
直前に描画したものでなくても、描画オブジェクトが残っていれば出力できる。
ggp + geom_line() # ラインを追加描画 graph2ppt(ggp) # ラインを追加描画していないプロットがエクスポートされる > Exported graph as Rplot.pptx
（イメージ省略）
スライドの追加
同じ出力ファイル名を指定して、append = TRUEを指定することで、次のスライドとして追記することができるのでfor()などを使って、一度に多量のスライドを作成することもできる。
注意点は、
- 指定したファイルを開いたままにすると出力に失敗する*1
append = TRUEを指定しないと、同名のファイルに上書きされてしまう
for (sp in unique(iris$Species)) { ggp <- iris %>% filter(Species == sp) %>% ggplot(aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, colour = Petal.Length)) + geom_point() + labs(title = sp) graph2ppt(ggp, file = "./my_plot.pptx", append = TRUE) } > Exported graph as ./my_plot.pptx > Exported graph as ./my_plot.pptx > Exported graph as ./my_plot.pptx
データフレームをPowerPointにエクスポート
データフレームの先頭の数件を表としてスライドに埋め込んでみる。全件埋め込むと、たいていの場合はひどいことになるので要注意。
iris %>% head() %>% table2ppt(append = TRUE) > Exported table as Rtable.pptx
（イメージ省略）
プロットとサマリーを組み合わせたスライドとかが便利そう。
ggp <- iris %>% ggplot(aes(y = Sepal.Width, x = Sepal.Length, color = Species)) + geom_point() + geom_smooth(method=lm) graph2ppt(ggp, file = "./iris.pptx") > Exported graph as ./iris.pptx tbl <- iris %>% group_by(Species) %>% group_modify(~ broom::tidy(lm(Sepal.Width ~ Sepal.Length, data = .x))) %>% table2ppt(file = "./iris.pptx", append = TRUE) > Exported table as ./iris.pptx
その他のオブジェクトをPowerPointにエクスポート
summary.lm()やsummary.lm()なども直接放り込めば表にしてくれる。*2
一部のオブジェクトはadd.rownames = TRUEを指定して、行名を明示的に取り込む必要があるので注意。
fit <- lm(Sepal.Width ~ Sepal.Length, data = iris) x <- summary(fit) tbl <- table2ppt(x = x, file = "./iris_ggplot.pptx", add.rownames = TRUE, append = TRUE) > Exported table as ./iris_ggplot.pptx
（イメージ省略）
その他のエクスポート
MS Office以外の出力にも充実しているので、好きなファイル形式にお任せで出力したいときには良いのでは。
作図データのエクスポート
graph2office()は、オプションで様々な調整ができるが、代表的なものだけ紹介。
- aspectr アスペクト比の調整
- orient 用紙の縦横向きの指定（"auto", "portrait", "landscape"）
- upscale
TRUEを指定すると用紙いっぱいになるまでプロットを拡大する
表データのエクスポート
data.frameをはじめとして、xtable::xtable()とbroom::tidy()でサポートされているオブジェクトを出力できる。ファイル名を指定しない場合、Rtable＋拡張子というファイルが作られる。
Excelへのエクスポート
table2excel()はopenxlsxパッケージの機能をコンパクトにまとめてくれている。loadWorkbook()またはcreateWorkbook() → addWorksheet() → createStyle() → writeData() → addStyle() → saveWorkbook()をしなくていいので、お手軽でいい。
エクセルは同一ファイル内で同名のシートを許さないので、append = TRUEでシートを追加しようとするとエラーになる。
tbl <- table2excel(iris, "./my_table.xlsx") > Exported table as ./my_table.xlsx tbl <- table2excel(iris, "./my_table.xlsx", append = TRUE) > Error in addWorksheet(doc, sheetName = sheetName): A worksheet by that name already exists! Sheet names must be unique case-insensitive.
シートを追加したい場合はsheetNameオプションをつかって、重複しないようにシート名をつけてやればよい。
sheet_index = 2 tbl <- table2excel(iris, "./my_table.xlsx", append = TRUE, sheetName = paste("sheet", sheet_index)) > Exported table as ./my_table.xlsx
table2csv()はwrite.csv()でもよさそうに思うが、lmなどの各種オブジェクトをわざわざ自分でテーブル形式にしなくてもdata.frameを返してくれるので、一時ファイルの保存機能付きお手軽コンバータとしても使える？かも。
fit <- lm(yield ~ block + N * P + K, npk) x <- summary(fit) tbl <- table2csv(x) > Exported table as Rtable.csv tbl %>% str > 'data.frame': 10 obs. of 4 variables: > $ Estimate : num 52.86 3.42 6.75 -3.9 -3.5 ... > $ Std. Error: num 2.55 2.8 2.8 2.8 2.8 2.8 2.28 2.28 1.61 3.23 > $ t value : num 20.71 1.22 2.41 -1.39 -1.25 ... > $ Pr(>|t|) : chr "<0.01" "0.24" "0.03" "0.18" ... > - attr(*, "align")= chr "r" "r" "r" "r" ... > - attr(*, "digits")= num NA 2 2 2 NA > - attr(*, "display")= chr "s" "f" "f" "f" ...
また、多彩なオブジェクトに対応しているのだが、あくまでxtable::xtable()とbroom::tidy()が扱えるものに限られるため、例えばarray には対応してなかったりする。
table2excel(iris3) > Error in table2spreadsheet(..., type = "XLS"): array is currently not supported by table2office xtable::xtable(iris3) > Error in UseMethod("xtable"): 'xtable' をクラス "c('array', 'double', 'numeric')" のオブジェクトに適用できるようなメソッドがありません broom::tidy(iris3) > Error: All columns in a tibble must be 1d or 2d objects: > * Column `x` is array
Word／PowerPointへのエクスポート
table2doc()とtable2ppt()も内部ではflextableに渡すための面倒な調整をやっている。素直に恩恵にあずかりたい。
rgl 3Dオブジェクトのエクスポート
rglパッケージが出力する3DプロットをPNGで保存する。現在のバージョンではPNG形式しかサポートしていない。サンプルコードはあるものの、(いまではPNGもサポートされていない)https://stackoverflow.com/questions/4543272/rgl-snapshot-no-longer-worksらしい
# Create a file name filen <- tempfile(pattern = "rgl") # or # filen <- paste("YOUR_DIR/rgl") # Generate a 3D plot using 'rgl' x = y = seq(-10, 10, length = 20) z = outer(x, y, function(x, y) x^2 + y^2) rgl::persp3d(x, y, z, col = 'lightblue') # Save the plot as a png rgl2png(file = "temp.png")
